Modele de case mici fara mansarda

Le Wellcome Trust Case Control Consortium, 2007 [6] un document novateur qui rapporte des études de GWA sur sept maladies, dont le CD. Plusieurs nouveaux gènes impliqués dans l`IBD ont été rapportés. L`analyse de réseau représente une alternative prometteuse dans de telles circonstances limitées de données [22 – 24]. Comme beaucoup de voies moléculaires dans l`EIA sont qualitativement bien décrites, les réseaux d`interaction peuvent être une approche appropriée pour caractériser l`EIA. Ces réseaux sont des représentations simplifiées des systèmes biologiques dans lesquels les composants du système tels que les gènes, les protéines ou les cellules sont représentés par des noeuds et les interactions entre eux par les arêtes [25]. Les modèles de réseau booléen, initialement introduits par Kauffman [26, 27], représentent les modèles dynamiques discrets les plus simples. Ces modèles supposent seulement deux États discrets pour les noeuds d`un réseau, ON ou OFF, correspondant aux valeurs logiques 1 (actif) ou 0 (non actif, mais pas nécessairement absent) [28]. Un modèle logique bien conçu pourrait générer des résultats prédictifs en raison d`un ensemble de conditions initiales. Des cadres qualitatifs et logiques ont émergé comme des approches pertinentes avec différentes applications, comme en témoigne un nombre croissant de modèles publiés [29].

En complément de ces applications, plusieurs groupes ont fourni diverses méthodes et outils pour soutenir la définition et l`analyse des modèles logiques, comme cela peut être vu par les récentes réalisations du Consortium pour les modèles et outils logiques (CoLoMoTo) dans la logique modélisation [30]. Il existe déjà plusieurs outils pour la modélisation booléenne des réseaux de régulation dans lesquels il est possible de définir des relations directes d`inhibition d`activation entre les composants du réseau, tels que BoolNet R [31] ou GINsim [32]. Plus récemment, le paquet R SPIDDOR (pharmacologie des systèmes pour le développement efficace de médicaments sur R), entre autres, a mis en place de nouveaux types d`interactions et de perturbations réglementaires dans le système, tels que les modulateurs positifs et négatifs et la les altérations du polymorphisme, qui conduisent à une dynamique plus riche entre les noeuds [28]. Les individus avec des mutations dans le gène NOD2 conduisant à la protéine NOD2 altérée ont accru le risque pour le CD iléal-seulement et le cédécolonique, mais pas le CD de colonic-seulement ni l`UC. Ce risque est particulièrement élevé pour les individus homozygotes ou hétérozygotes composés. NOD2 active une voie de signalisation NF-κB lors de la liaison du composant peptidoglycane MURAMYLE dipeptide. La définition de tous les noeuds et les interactions réglementaires complètes et documentées conformes à la structure du modèle peuvent être trouvées dans les informations de support S1 table et S2 table, respectivement. Le tableau S2 est fondamental pour comprendre la justification de la sélection et de la mise en œuvre des fonctions booléennes (BF).

Il a été organisé pour fournir un résumé complet des 301 manuscrits (publiés au cours des trois dernières décennies) utilisés pour construire le modèle, en soulignant par exemple si (i) une voie spécifique a été signalée pour être modifiée dans IBD, ou (II) l`information a été soutenue par l`homme (plus de 80% de la structure du réseau) ou des données animales. Bien que les mécanismes immunitaires soient impliqués dans l`EIA, les études immunologiques, après rapprochement environ 50 ans, n`ont pas encore démontré une vulnérabilité antécédente chez les patients ou chez les membres sains des familles d`IBD. La plupart des phénomènes immunologiques décrits dans l`IBD jusqu`à présent, apparaissant et disparaissant avec l`activité et la quiescence de la colite ulcéreuse ou de la maladie de Crohn, représentent des événements secondaires, des réflexions d`un dysfonctionnement du système immunitaire de la muqueuse intestinale Système. Néanmoins, l`intérêt immunologique se poursuit dans le système mucosalimmunitaire associé à l`intestin, l`accès aux antigènes M et les cellules dendritiques de l`épithélium intestinal, les récepteurs des antigènes cellulaires T et les modèles animaux transgéniques [109]. L`intérêt se développe également dans l`identification de l`antigène (s) (probablement les composants de la flore intestinale) reconnus par les anticorps anti-neutrophiles cytoplasmiques sériques présents dans la colite ulcéreuse. La vue actuelle de la colite ulcéreuse met l`accent sur une réactivité accrue du système immunitaire muqueuse intestinal, impliquant des cellules t de la maladie de Crohn et des cellules t dans la colite ulcéreuse chez des individus génétiquement vulnérables.